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多分ご理解の通りかと思います。
スナップショット共有フォルダーの方が、後から出てきた機能です。
QNAP、単一フォルダのスナップショットと復元のパフォーマンスを90%アップさせる「スナップショット共有フォルダ」を発表
元は一つのボリュームに複数の共有フォルダーが存在している状態であり、互換性のためにもその状態にも対応する必要があるかと思います。
また人によっては細かく共有フォルダーを分けている可能性もあります。それぞれに独立ボリュームを割り当てることは現実的ではないかと思います。